پس از حمله قبلی گودزیلا، یک مسابقه تسلیحاتی کوچک برای جمع‌آوری سلول‌های او آغاز می‌شود. دولت ژاپن که نگران بازگشت احتمالی گودزیلا است، از این سلول‌ها برای ساخت یک سلاح زیستی جدید به نام ANEB (باکتری انرژی ضد هسته‌ای) استفاده می‌کند. آن‌ها از یک متخصص ژنتیک به نام گنشیرو شیراگامی کمک می‌خواهند که آزمایش‌های او منجر به یک جهش ژنتیکی جدید می‌شود.

آینده‌پژوهان، مسافران زمانی از قرن بیست‌وسوم، وارد ژاپن می‌شوند تا به آن‌ها درباره نابودی کشور به دست گودزیلا هشدار دهند. آن‌ها پیشنهاد می‌کنند که با جلوگیری از خلق گودزیلا، او را از تاریخ حذف کنند. با ناپدید شدن ظاهری گودزیلا، هیولای جدیدی ظاهر می‌شود و نیت واقعی مسافران زمان برملا می‌گردد.

جک الیوت، ارزشمندترین بازیکن سابق نیویورک یانکیز، اکنون در دوران افول حرفه بیسبال خود قرار دارد. با کاهش میانگین ضرباتش، آیا او هنوز یک سال خوب دیگر در پیش دارد و آیا مدیر تیم چونیچی دراگونز در لیگ بیسبال مرکزی ژاپن می‌تواند این استعداد را دوباره در او زنده کند؟

پس از وقایع فیلم قبلی، یوی کازاما ۱۷ ساله که با نام سوکیبان دکا ۳ شناخته می‌شود، به همراه خواهران بزرگترش یوکا و یوما برای اداره امنیت نوجوانان کار می‌کند. این سازمان توسط سیاستمداری به نام کورادو سکین اداره می‌شود که با روش‌های خشن با جرم و جنایت نوجوانان مبارزه می‌کند، تا حدی که ماموران دانش‌آموز خود را به سلاح‌های یویو با تیغه‌های سه‌گانه مجهز می‌کند. با این حال، وقتی روش‌های سکین بیش از حد افراطی می‌شود، یوی از اداره استعفا داده و از انجام ماموریت‌های مخفیانه برای آن‌ها خودداری می‌کند. به زودی فاش می‌شود که هدف واقعی سکین سرنگونی دولت ژاپن است و خواهران کازاما به همراه گروهی از جوانان طردشده باید جلوی او را بگیرند.

پس از قتل یک دانشجوی دختر و افشای سهل‌انگاری پلیس، ایزومی به دوست خبرنگارش مشکوک می‌شود. اما وقتی دوستش مرده پیدا می‌شود، ایزومی با عذاب وجدان برای کشف حقیقت وارد ماجرا می‌شود و ...

باوجود اینکه یاسو به عنوان یک یتیم بزرگ شده، در بزرگسالی زندگی بسیار خوبی دارد. تا اینکه همسرش در یک تصادف می میرد و یاسو با بحران بزرگی مواجه می شود. او باید پسرش را به تنهایی بزرگ کند و ...

پسری جوان به نام جیک که به عنوان اولین روزنامه نگار جنایی آمریکایی در توکیو استخدام شده است، به سرعت وظیفه پوشش دادن دو پرونده را به عهده می‌ گیرد، اما به زودی شغل و زندگی او در معرض خطر قرار می گیرند و ...

هر روز یک دانش آموز دبستانی به نام میبو حول محور عشقش به ماهی می چرخد. او هر روز آنها را می بیند، می کشد و می خورد. پدرش نگران میبو است، زیرا به نظر می رسد او با بچه های دیگر متفاوت است. مادرش در مقابل او را به گرمی تماشا می کند و ...

کنجی که از نوجوانی توسط یک خانواده یاکوزا بزرگ شده است، اکنون با رئیس این باند رابطه ای پدر و پسری دارند. کنجی تمام تلاشش را می کند که به قوانین خانواده یاکوزایی اش پایبند بماند اما...

بیگانه ها به زمین آمده اند و به طور طبیعی شروع کرده اند به تصاحب جایگاه بشریت، یک انسان بنام "شین لزومی" درون دست راستش انگلی دارد که بیگانه ها به او تزریق کرده بودند، این انگل نیرویی به اون می دهد که می تواند جلوی نابودی نسل بشر را بگیرد و ...

هنگامی که یک مقام دولتی به قتل می رسد، یک مامور آمریکایی با تجربه برای بررسی قتل ماموریت پیدا می کند و…

قرن شانزدهم در ژاپن، یک مرد جوان باید بین شغل آهنگری مانند پدر و پدربزرگش و قبل از ان، یا تبدیل شدن به یک سامورایی یکی را انتخاب کند و ....

تاتسوهیکو از شینجوکو به یوکوهاما نقل مکان می‌کند، جایی که با ماساکی تاکی، مدیرعامل شرکت استعدادیابی محلی، وارد درگیری و رقابت می‌شود.

در اوایل دهه ۱۹۹۰، آزمایش‌هایی به صورت مخفیانه در ژاپن انجام شد. در این آزمایش‌ها از دو روش متفاوت استفاده شد. یک روش شامل اعمال استرس شدید به والدین در انتظار فرزند بود تا پس از تولد نوزاد، جهش‌هایی در او ایجاد شده و توانایی‌های خاصی در او شکل بگیرد. روش دیگر شامل تولد نوزادانی بود که توانایی‌های حیوانات و حشرات را داشتند. این توانایی‌های ویژه از طریق دستکاری ژنتیکی به دست آمده بودند. سوبارو، سایا و دیگران حاصل این آزمایش‌ها بودند.

شیراتوری تاتسوهیکو به عنوان استعدادیاب برای آژانس «برست» در کابوکیچو، محله بدنام شینجوکو، کار می‌کند و دختران جوان را برای صنعت سرگرمی بزرگسالان استخدام می‌کند. در تجارتی که پول حرف اول و آخر را می‌زند، تاتسوهیکو خود را درگیر مبارزه‌ای مداوم میان استعدادیاب‌های رقیب و یاکوزا می‌بیند.

بشریت از مجموعه‌ای از قتل‌های مرموز در سراسر جهان رنج می‌برد که به «قتل‌های گوشت چرخ‌کرده» معروف شده‌اند. شینیچی ایزومی، دانش‌آموز دبیرستانی، انگلی در بدن دارد که جایگزین دست راست او شده است و او ممکن است تنها کسی باشد که حقیقت را کشف می‌کند.

شینوبو تاکامورا نقاشی جاه‌طلب است. یک روز او به استفاده از پول تقلبی متهم می‌شود. شینوبو از این اتهام گیج شده است، زیرا هرگز چنین کاری نکرده و در زمان وقوع جرم در خانه بوده است. سپس افسر پلیس، کانو، ظاهر می‌شود و او را به مکانی می‌برد. وقتی به آنجا می‌رسند، گروهی از مردم از قبل دور هم جمع شده‌اند. همه افراد حاضر در آنجا نگران وجود موجودی شبیه به همزاد هستند که دقیقاً شبیه آن‌ها به نظر می‌رسد و مانند آن‌ها رفتار می‌کند. آن‌ها این پدیده را «بیلوکیشن» یا همزاد می‌نامند.

کنجی که توسط مادرش رها شده است، با انجام کارهای متفرقه از جمله رساندن مهمانداران بارها و مشتریانشان به خانه، زندگی ناچیزی را می‌گذراند. علاوه بر این، او از خواهر یکی از دوستان قدیمی‌اش که در زندان است و یک مهاجر غیرقانونی جوان مراقبت می‌کند. در نهایت، زندگی او به یک نقطه عطف می‌رسد.

وقتی در سال ۱۹۷۲ شبه‌نظامیان تندرو ارتش سرخ ژاپن زنی را در شهر تفریحی کاروئیزاوا در استان ناگانو به گروگان گرفتند، افسر آتسویوکی ساسا مأمور حل این بحران شد. اما این مأموریت چالش‌های سختی به همراه داشت. ساسا پس از ورود به منطقه کوهستانی ناگانو، باید با سرمای استخوان‌سوز زمستان، اختلاف‌نظرهای شدید میان پلیس توکیو و پلیس محلی ناگانو و همچنین فشار افکار عمومی دست‌وپنجه نرم می‌کرد تا بتواند راهی برای ورود به کلبه‌ای که زن در آن اسیر بود پیدا کند.

«یوتاکا» که در ۱۴ سالگی بر اثر یک تصادف رانندگی به کما رفته بود، ده سال بعد بیدار می‌شود و می‌فهمد که خانواده‌اش دیگر در کنار هم نیستند و پدر، مادر و خواهرش در مکان‌های مختلفی زندگی می‌کنند. او تصمیم می‌گیرد مزرعه‌ای را که خانواده‌اش زمانی اداره می‌کردند، دوباره راه‌اندازی کند.